عبد العزيز سالم (1957 - 1958)
يعتبر المهندس المصري عبدالعزيز عبدالله سالم أول رئيس للاتحاد الإفريقي لكرة القدم وأحد مؤسسيه، وقد كان قبلها يشغل منصب رئيس الاتحاد المصري لكرة القدم، ويعتبر كذلك أحد مؤسسي بطولة كأس الأمم الإفريقية ، وقد تمت تسمية أول كأس للبطولة باسمه تكريماً له (كأس عبد العزيز سالم) والتي فاز فيها منتخب غانا ثلاث مرات واحتفظ بالكأس مدى الحياة.
محمد عبد العزيز مصطفى (1958 - 1968)
يعتبر عبدالعزيز مصطفى ثاني رئيس للاتحاد والذي شغل المنصب لمدة عشر سنوات، وحلّ اللواء محل عبد العزيز سالم خلال انعقاد الجمعية العامة الثالثة للاتحاد الإفريقي والتي أقيمت في ستوكهولم بسبب العلاقة المتوترة التي كانت بين سالم ورئيس الاتحاد المصري لكرة القدم وقتها، وتم الاتفاق أنّ الاجتماع القادم للاتحاد سوف يعقد في مصر، وفي عام 1961 تم إعادة انتخاب عبد العزيز مصطفى رئيساً للاتحاد الإفريقي لكرة القدم.
عبد الحليم محمد
يعتبر الطبيب والسياسي السوداني عبد الحليم محمد أول رئيس لاتحاد كرة القدم السوداني وأحد مؤسسي الاتحاد الإفريقي لكرة القدم، وقد شغل منصب رئيس الاتحاد الإفريقي مرتين عامي (1968 - 1972) و (1987 - 1988)، ومنحه الاتحاد الإفريقي الرئاسة الفخرية مدى الحياة تكريماً وتقديراً له، وتوفي عام 2009 وكان عمره حينها 99 عامًا.
يدنكاتشو تسيما (1972 - 1987)
تولى الإثيوبي يدنكاتشو تسيما منصب رئيس الاتحاد الإفريقي لكرة القدم لمدة خمسة عشر عاماً، وهو رابع رئيس للاتحاد، وقد كان تسيما عضواً مؤثراً وأحد مؤسسي الاتحاد الإفريقي، وشغل كذلك العديد من المناصب مثل منصب نائب الرئيس (1964 - 1972) وكان عضواً في المؤتمر الرياضي الإفريقي ولجنة الأولمبياد الدولية، توفي تسيما عام 1988 ومنحه الاتحاد الإفريقي الرئاسة الفخرية بعد وفاته.
عيسى حياتو (1988- 2017)
يعدّ الرياضي الكاميروني عيسى حياتو الرئيس السابق للاتحاد الإفريقي لكرة القدم، وقد شغل مؤقتاً منصب رئيس الفيفا FIFA عام 2015 بعد إيقاف رئيسه السابق جوزيف بلاتر من قِبَل لجنة الاتحاد في تحقيقات الفساد، واستمر حياتو رئيساً للاتحاد الدولي FIFA لمدة عام حتى تم اختيار جياني إنفانتينو رئيساً للاتحاد عام 2016، وفي عام 2017، خسر لقب رئيس الاتحاد الإفريقي أمام أحمد أحمد، وفي نفس العام عُيّن من قِبَل رئيس الكاميرون رئيساً للأكاديمية الوطنية لكرة القدم.
أحمد أحمد (2017 - 2021)
شغل السياسي والرياضي السابق من مدغشقر أحمد أحمد منصب رئيس الاتحاد الإفريقي لكرة القدم عام 2017 بعد فوزه على عيسى حياتو في الانتخابات التي أجريت في أديس أبابا ، تولى أحمد أحمد مناصب أخرى عديدة مثل عضو اللجنة التنفيذية بالاتحاد الإفريقي ورئاسة اتحاد مدغشقر مرتين، وتولى كذلك منصب وزير الرياضة في بلاده، في عام 2020 تم إيقافه من قبل الفيفا لمدة خمس سنوات بسبب خرقه للائحة أخلاقيات الفيفا وسوء السلوك المالي وسوء استغلال منصبه كرئيس الاتحاد الإفريقي.
باتريس موتسيبي (2021 - حتى الآن)
يعدّ باتريس موتسيبي رجل أعمال جنوب إفريقي وأهم رجال صناعة التعدين في إفريقيا، وهو الرئيس الحالي للاتحاد الإفريقي لكرة القدم، في عام 2003 قام موتسيبي بامتلاك نادي ماميلودي صن داونز Mamelodi sundowns والذي يعتبر من أكبر الفرق بجنوب إفريقيا، ويعدّ هذا الحدث بداية شهرة موتسيبي في جنوب إفريقيا .
